生命科學研究技術(shù)在不斷發(fā)展和進步，生物學的研究層面也在不斷拓展，從組織到細胞再到細胞的空間分布定位，生命科學的研究正在進行從二維到三維的巨變?？臻g轉(zhuǎn)錄組是這一轉(zhuǎn)變的引領者之一。
剛剛過去的5月，又是收獲滿滿的一個月。5月份共有4篇客戶文獻影響因子大于10，分別發(fā)在J Clin Invest、Hepatology、Nat Commun和Journal of Hepatology。伯豪生物服務涉及ceRNA芯片，表達譜芯片，RNA 測序分析等。
lncRNA的機制研究相當困難，主要實驗過程復雜，實驗量巨大，如果想發(fā)超10分的高分文章并且有好的研究思路可以從這個角度探索。其實我們可以換個角度研究lncRNA，不要將lncRNA作為一個調(diào)節(jié)分子；而是把lncRNA當做和mRNA一樣的分子來研究。在體外，可以通過分子干擾手段，進行分子及表型研究；在體內(nèi)，也是如此。兩者通過各種組合，也能輕松get一篇5分以上的文章。
類風濕性關節(jié)炎(RA)的診斷主要基于臨床癥狀和類風濕因子(RF)，抗瓜氨酸肽抗體(抗CCP)的血清學陽性，而銀屑病關節(jié)炎(PsA)只有臨床和影像學特征有助于診斷。雖然大多數(shù)RA患者RF，抗CCP血清陽性，但約15%-20%的RA病例中，血清中RF和抗CCP水平并未升高，由于血清陰性RA(negRA)和PsA的癥狀非常相似，且沒有可靠的臨床標志物，因此 ,兩者的鑒別診斷十分困難。
我們以前熟悉的研究，往往從轉(zhuǎn)錄組起始，測得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)后，尋找差異表達顯著的基因。然后，分別有生物標志物方向和機制研究方向，兩種套路成文。蛋白組學也有類似的套路。今天，招財貓講述的文章是機制研究方向的。我們來看下吧！
環(huán)狀RNA (circRNAs)是共價封閉的長鏈非編碼RNA，在多種細胞活動和多種人類疾病中具有重要作用。在雙鏈DNA病毒(dsDNA)中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了幾種與癌癥相關的病毒circRNA。研究人員通過計算預測來自病毒感染相關RNA測序數(shù)據(jù)的病毒circRNA，對23個病毒物種的11924個circRNA進行了系統(tǒng)調(diào)查。除了dsDNA病毒外，研究還揭示了單鏈RNA病毒和逆轉(zhuǎn)錄病毒中的大量circRNA，如寨卡病毒、甲型流感病毒、扎伊爾埃博拉病毒和人類免疫缺陷病毒。
近年來，非編碼RNA（ncRNA）調(diào)控一直是生物學研究，特別是疾病研究的熱點；包括miRNA、rRNA、tRNA、lncRNA和circRNA等多種未知功能的RNA。大部分的環(huán)狀RNA是由外顯子序列構(gòu)成，在不同的物種中具有保守性，同時存在組織及不同發(fā)育階段的表達特異性。由于circRNA對核酸酶不敏感，所以比線性RNA更為穩(wěn)定，這使得circRNA在作為新型臨床診斷標記物的開發(fā)應用上具有明顯優(yōu)勢，今天就與大家分享幾篇circRNA領域的新研究。
