伯豪生物公司樣本中心采用 LIMS 系統(tǒng)進(jìn)行樣本全程管理，年分析樣本 30000 多例，經(jīng)過十年的經(jīng)驗(yàn)積累，平臺已經(jīng)掌握對大多數(shù)物種、類型 RNA 的抽提方法 - 如人（新鮮組織，胸水，全血，血清，血漿，石蠟片，顯微切片組織），RNA 或 DNA 產(chǎn)量、純度和完整性是確保下游研究應(yīng)用（微陣列芯片、新一代測序，Real-Time PCR 等）中獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。
一、生物樣品儲存
伯豪生物充足的樣本儲存空間，實(shí)時監(jiān)控，專人管理，嚴(yán)格的樣本接收、返還、銷毀 SOP，確保客戶樣本資源得到很好的管理和保護(hù)。
二、生物樣品提取
伯豪生物引進(jìn)了無 RNA 酶污染的組織粉碎系統(tǒng)，采用一次性的勻漿頭和勻漿管，以避免樣品處理過程中的污染。針對不同物種、類型，選用相應(yīng)的 SOP 進(jìn)行樣本的抽提。
三、生物樣品分析
伯豪生物采用了 NanoDrop 和 Agilent 2100 核酸質(zhì)檢系統(tǒng)進(jìn)行樣品質(zhì)檢工作。該系統(tǒng)僅需微量的 RNA 樣品，就能將樣品的濃度、質(zhì)量等信息測定，更能將其所測得的數(shù)據(jù)信息模擬成凝膠電泳圖，給人以清晰直觀的效果。上海伯豪的所有 RNA 樣品均采用 Agilent 2100 系統(tǒng)質(zhì)檢，跟傳統(tǒng)凝膠電泳方法相比較，結(jié)果更可靠，更利于保存和比較。
伯豪生物經(jīng)過十年的經(jīng)驗(yàn)積累，平臺已經(jīng)掌握對大多數(shù)物種、類型 RNA 的抽提方法 - 如人（新鮮組織，胸水，全血，血清，血漿，石蠟切片，顯微切割組織，穿刺樣本等）、小鼠、羊、牛、兔子、雞、斑馬魚、線蟲、水稻、擬南芥、甘蔗、種子、小麥、油菜、大腸桿菌、枯草桿菌、天藍(lán)色鏈霉菌、豬鏈球菌等，以及全血、組織中 DNA 的抽提方法。針對不同物種、類型選擇相應(yīng)的抽提方法，并幫助客戶選擇穩(wěn)定的試劑進(jìn)行抽提，確保 RNA/DNA 的總量及質(zhì)量滿足后續(xù)的實(shí)驗(yàn)要求。
Agilent 2100 RNA 質(zhì)檢部分實(shí)例（來源：2011 年）：
伯豪生物定制了天梭 TS10000 高性能集群，該集群在設(shè)計上專注于提高 HPC 應(yīng)用的運(yùn)行效率，增強(qiáng)系統(tǒng)的可擴(kuò)展性，致力于提升系統(tǒng)的總體的計算能力、加速節(jié)點(diǎn)間的數(shù)據(jù)交換和系統(tǒng)的 I / O 帶寬。同時伯豪生物還根據(jù)實(shí)際運(yùn)算需求，開發(fā)了不同級別的軟件應(yīng)用，促進(jìn)系統(tǒng)內(nèi)部服務(wù)器、存儲、應(yīng)用之間趨近于協(xié)同運(yùn)算。伯豪生物生信分析平臺整體硬件設(shè)計采用了“高性能計算節(jié)點(diǎn) + 高速網(wǎng)絡(luò) + 高效能存儲”的整套定制方案。并開發(fā)了 SBC Analysis System（SAS 系統(tǒng)）等基于 web 頁的在線生物芯片自助分析系統(tǒng)，伯豪生物為客戶提供一站式生物信息解決方案。
四、生信分析（硬件設(shè)備）：
伯豪生物提供“高性能計算節(jié)點(diǎn) + 高速網(wǎng)絡(luò) + 高效能存儲”的整套解決方案
上海伯豪生物技術(shù)有限公司（以下簡稱“伯豪生物”）根據(jù)自身基因組學(xué)服務(wù)的需要定制了天梭 TS10000 高性能集群，共由 20 個節(jié)點(diǎn)和 1 個存儲構(gòu)成，儲存能力達(dá)到 150TB，計算能力超過 1.8 億次每秒以上。伯豪生物在該集群設(shè)計上專注于提高 HPC 應(yīng)用的運(yùn)行效率，增強(qiáng)系統(tǒng)的可擴(kuò)展性，致力于提升系統(tǒng)的總體計算能力、加速節(jié)點(diǎn)間的數(shù)據(jù)交換和系統(tǒng)的 I / O 帶寬。同時，伯豪生物還根據(jù)實(shí)際運(yùn)算需求，開發(fā)了不同級別的軟件應(yīng)用，促進(jìn)系統(tǒng)內(nèi)部服務(wù)器、存儲、應(yīng)用之間趨近于協(xié)同運(yùn)算。
伯豪生物生信分析平臺整體硬件設(shè)計采用了“高性能計算節(jié)點(diǎn) + 高速網(wǎng)絡(luò) + 高效能存儲”的整套定制方案。伯豪生物生信分析平臺計算節(jié)點(diǎn)采用的是基于 Intel? 至強(qiáng)？5500 處理器的浪潮 NF5220 和四路六核服務(wù)器 NF520D2。伯豪生物生信分析平臺集群不只計算性能高，還具有高擴(kuò)展、低功耗的特點(diǎn)，由于采用了智能功耗控制技術(shù)，該集群整體功耗比同類產(chǎn)品至少降低 10%，在任務(wù)較少時，還可以通過浪潮天梭監(jiān)管軟件遠(yuǎn)程關(guān)閉沒有工作的節(jié)點(diǎn)，進(jìn)一步節(jié)能減耗。
五、生信分析（軟件分析）
伯豪生物提供商業(yè)化和自主開發(fā)相結(jié)合的微陣列芯片生物信息分析綜合解決方案。
伯豪生物信息平臺的軟件系統(tǒng)采用商業(yè)化和自主開發(fā)相結(jié)合的方式建立了微陣列芯片數(shù)據(jù)分析綜合解決方案，可針對表達(dá)譜芯片、miRNA 芯片、SNP 芯片、DNA 甲基化芯片、CGH 芯片等提供各種伯豪生物個性化服務(wù)。
同時，伯豪生物還針對（臨床、科研）工作者的工作需要：“ 開發(fā)向伯豪用戶開放的個性化實(shí)時在線分析系統(tǒng)—Shbio Analysis System，SAS 系統(tǒng)”。【文字直達(dá)】
伯豪生物（SBC Analysis System，SAS 系統(tǒng)） 該系統(tǒng)核心算法基于 R 語言（R-software) 程序包，可以完成大部分的表達(dá)譜分析運(yùn)算，伯豪生物 （SBC Analysis System，SAS 系統(tǒng)） 系統(tǒng)本地整合 8 大公共數(shù)據(jù)庫，實(shí)現(xiàn)對多個數(shù)據(jù)庫的交叉查詢，幫助您發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)揭示的生物學(xué)意義。
伯豪生物（SBC Analysis System，SAS 系統(tǒng)）屬于互聯(lián)網(wǎng) 在線分析系統(tǒng)，將幫助廣大 （臨床、科研） 工作者表達(dá)譜芯片進(jìn)行各類統(tǒng)計學(xué)分析和功能注釋工作。伯豪生物在線分析系統(tǒng)的這些分析包括：“差異倍數(shù)計算（Fold Change)，t 檢驗(yàn)（t-Test），SAM 檢驗(yàn)（Significant Analysis of Microarray, SAM)，一維方差分析（one-way ANOVA)，二維方差分析（two-way ANOVA)，相關(guān)性分析（Correlation analysis)，聚類分析（Unsupervised hierarchical clustering)，主成份分析（Principal Component Analysis，PCA)，GO 富集分析（GO enrichment analysis），pathway 富集分析（Pathway enrichment analysis)，microRNA 檢索，蛋白質(zhì)相互作用檢索（protein interaction) 等。”
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