
單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術的飛速發展使人們對組織中細胞種類、細胞的特殊狀態有了深入認識。但是,scRNA-seq對于器官或者固體組織制備的細胞懸液的細胞活性和細胞數目有著較高的要求,這也意味著 “躺在”超低溫冰箱中的大量珍貴臨床樣本(腦組織,腫瘤組織等)都無法進行scRNA測序。而單細胞核RNA測序技術(snRNA-seq)的出現,則在很大程度上解決了以上問題。
生命科學研究技術在不斷發展和進步,生物學的研究層面也在不斷拓展,從組織到細胞再到細胞的空間分布定位,生命科學的研究正在進行從二維到三維的巨變。空間轉錄組是這一轉變的引領者之一。
人類細胞圖譜計劃,旨在繪制人體的每一種細胞類型。人類心臟圖譜的相關數據公布在國際尖端期刊《Nature》上。該研究利用10x Genomics技術,對健康人心臟的近50萬個單細胞進行了測序分析,構建了迄今為止較為廣泛的人類心臟細胞圖譜。
腸道生態環境的改變與人類健康與疾病顯著相關。腸道代謝物,包括氨基酸和細菌代謝物(eg. 膽汁酸和短鏈脂肪酸)與腸癌狀態有關。因此,通過宏基因組和代謝組分析可以為了解腸道環境的變化與CRC的發展提供方法。
轉眼9月已經過去,小編在這里為大家精心上收集了以DNA甲基化研究為主題的新研究成果,截止現在,9月以DNA methylation為關鍵詞檢索到的文獻一共有603篇,小編在這里為大家精心挑選了以下6篇作為重點分享。
現在很多的研究同時進行Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq,為了明確單細胞測序分析結果的準確性,可以利用相同樣本的 Bulk RNA-Seq 數據進行評估,兩種測序結果相互印證。
九月份單細胞測序相關文獻共收集到48篇(IF>9),文末列表中列出文獻發表期刊、研究方向和技術平臺等信息,接下來先看看其中6篇。
伯豪生物鄧老師給大家介紹一下對轉錄組TCGA & GEO的數據進行分析,包括差異分析、富集分析、單基因展示以及其它個性化做圖。