本期的主題是胃腸道腫瘤，為大家搜集了RNA m6A修飾的相關(guān)研究，樣本類型有全血、細胞和組織。其中全血樣本的研究主要為了尋找標志物，而細胞和組織通常會結(jié)合出現(xiàn)，以便進行深入的機制研究。

伯豪生物通過互聯(lián)網(wǎng)收集到8月單細胞測序相關(guān)文獻41篇（平均IF>9），于本文末列出單細胞測序文獻發(fā)表期刊、研究方向和技術(shù)平臺等信息，伯豪生物隨機挑選了其中5篇，供大家查閱，以期望提供更多單細胞測序科研思路給科研領(lǐng)域內(nèi)的各位科研工作者。

伯豪生物單細胞測序常用研究方向分析，從客戶單細胞揭示胰腺導(dǎo)管腺癌（PDAC）的異質(zhì)性和惡化發(fā)展闡述單細胞測序的熱點及案例解讀，以圖文并茂的方式闡述了單細胞測序科研技術(shù)成果，編者寄希望通過單細胞測序的熱點及案例的解讀帶給讀者更加適合的科研視角。

轉(zhuǎn)眼8月已經(jīng)過去，伯豪生物為大家精心收集了以DNA甲基化研究為主題的較新研究成果，截止發(fā)文，伯豪生物8月以DNA methylation為關(guān)鍵詞檢索到文獻一共有536篇，伯豪生物精選了6篇作為重點分享DNA甲基化分析研究寄希望帶給讀者更多的DNA甲基化研究思路，包括帕金森、腸炎、婦科癌癥和植物發(fā)育等DNA甲基化內(nèi)容的研究等。

一般我們拿到10x空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的結(jié)果先看的肯定是web_summary網(wǎng)頁報告，因為從這個結(jié)果里面我們大概就能判斷你的數(shù)據(jù)好不好，不好的問題在哪里，數(shù)據(jù)到底能不能用等等。這里來詳細介紹一下怎么看10x 空間轉(zhuǎn)錄組web_summary網(wǎng)頁版報告。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)是在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律，從RNA水平研究基因表達的情況。借助轉(zhuǎn)錄組學(xué)來研究腫瘤的發(fā)病機制，尋找用于腫瘤診斷和防治的生物標志物一直是腫瘤研究熱點，今天小編要和大家分享幾例轉(zhuǎn)錄組學(xué)在胃腸腫瘤中的應(yīng)用。

前面介紹 Space Ranger 的使用的時候有提到過，一種是自動對齊（只需要提供圖片文件），另外一種是手動對齊（除了需要提供圖片文件，還需要提供圖像組織位置跟 spot 對應(yīng)信息的 json 文件）。本文帶你一分鐘了解 10x空間轉(zhuǎn)錄組Visium 的 圖像手動對齊 應(yīng)該怎樣做！

具有完善基因表達數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)的大規(guī)模公共隊列為開發(fā)腫瘤預(yù)后標志提供了可能。近年來，機器學(xué)習(xí)作為人工智能（AI）的分支，已經(jīng)被成功用于建立腫瘤患者預(yù)后和治療預(yù)測的模型。

10x Genomics在分析軟件這一塊還是非常給力的，開發(fā)的每個軟件都非常好用而且操作簡單，特別是安裝方便，基本解壓后就能用。對于10x的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)主要用10x自己開發(fā)的Space Ranger來進行前期的處理。

乳腺癌是發(fā)生在乳腺上皮組織的惡性腫瘤，它是威脅全球女性健康的嚴重的常見的惡性腫瘤之一，近年來的發(fā)病率與死亡率也逐漸升高。因此，尋找和發(fā)現(xiàn)有價值的乳腺癌生物標志物已經(jīng)成為目前研究的一個重要方向。小編這次為大家分享兩篇關(guān)于研究乳腺癌DNA甲基化標志物的文章（IF > 10），利用多組學(xué)數(shù)據(jù)分別從兩個方向篩選甲基化標志物的研究。