935K 甲基化芯片(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一種全基因組甲基化篩選工具,靶向人類甲基化組最具生物學(xué)意義的區(qū)域中超過 935,000 個 CpG 位點,同時在其前代產(chǎn)品 Methylation EPIC v1.0(850K)的基礎(chǔ)上極大的提高了向后兼容性。該芯片保留了以單核苷酸分辨率定量分析全基因組 CpG 的能力,同時提供高度準確和精確的甲基化測量,不受測序深度的影響。可使用精簡、用戶友好的 Infinium 甲基化檢測分析多種 DNA 樣本類型,包括從 FFPE 分離的 DNA 樣本。與其他方法相比,Methylation EPIC v2.0 具有可擴展性和更低的單個樣本總成本,因此可用于探究疾病機制和生物標志物的篩選。
活動福利
項目周期: 自 DNA 質(zhì)控合格后標準生信分析結(jié)果發(fā)送 10 個工作日;
交付結(jié)果: 標準生信分析報告和原始數(shù)據(jù);
DNA 要求: 常規(guī) DNA 總量≥1ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280 在 1.8 左右;不得有其它個體或其它物種的 DNA 或 RNA 污染;溶解在 H20 或 TE (pH 8.0),特殊樣本視具體情況實驗。
活動時間:2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日
活動說明:
1、合同雙方簽訂完成時間必須在活動時間內(nèi);
2、單次送樣數(shù)目為 8 的倍數(shù);
3、活動最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
935K 芯片優(yōu)勢
935K 與 850K 芯片數(shù)據(jù)相關(guān)性
935K 甲基化芯片檢測能夠檢測到 0.2 的 beta 值差異,假陽性率低于 1%,從而實現(xiàn)了較高的分析靈敏度,同時也具有極好的數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性。
如下圖:
(A)935K 芯片技術(shù)重復(fù)相關(guān)性 R 2>0.99;
(B)935K 芯片和 850K 的交集探針間的相關(guān)性 R 2>0.99;
(C)935K 芯片數(shù)據(jù)與甲基化測序(100X 測序深度)的相關(guān)性 R 2>96%。
935K 芯片實測數(shù)據(jù)展示
嚴格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(簡稱 935K)操作手冊完成 DNA 抽提、轉(zhuǎn)化、擴增、雜交洗脫等,質(zhì)控結(jié)果說明雜交實驗過程穩(wěn)定、轉(zhuǎn)化率高、熒光信號和結(jié)合狀況良好,綜合說明實驗操作穩(wěn)定,可以進一步做甲基化的數(shù)據(jù)分析。