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1、伯豪生物豐富的懸液制備經驗
伯豪生物單細胞團隊 2019 年自主消化了包括人、鼠、豬、雞、魚、羊、牛、水稻、楊樹、番茄(植物樣品抽提細胞核)等在內的近千例樣品,平均上機率超過 60%(業內平均上機率為 35%-50%)。并在 2020 年 1 月制備懸液 100 余例,上機率達到 90%。消化過程均全部人工操作,積累了非常的單細胞懸液制備經驗。
2、較高的數據可重現性
單細胞團隊在自主消化并獲得原始數據后的分析結果顯示:肝臟、胃、皮膚、肺、視網膜、脂肪、腦、息肉、肌腱、血管、胚胎、心臟瓣膜、耳蝸、膽管、睪丸、子宮內膜等的分群數據和測得的基因數目可以比較好的重現組織內部的細胞亞群特征,數據的可重復性比較高。成功協助部分實驗室避免了研究人員由于學業的更替導致前后數據產出的不穩定。
視網膜分群數據(C0 亞群仍可繼續細分亞群)
注: 從細胞注釋的結果里可以看出,這批數據主要的細胞類型包括 9 大類,其中 T 細胞、NK 細胞和巨噬細胞占大部分。同時巨噬細分還分成了單核來源的巨噬細胞(MDSC-like cells)和肝臟固有的巨噬細胞(TAM-like cells)。
3、定制化的分析策略
單細胞團隊在后期數據分析方面,整理了多套個性化分析思路(腫瘤類的單細胞分析已經聯合 TCGA 數據庫做更多高級個性化分析),目前正在為幾十個科研團隊提供定制化的單細胞數據分析服務。
整體亞群 GSEA 功能分析
細胞間通訊分析

腫瘤細胞的良性惡性區分:Case 組(癌)包含較多腫瘤細胞,Control(癌旁)沒有檢測到腫瘤細胞

Marker 基因的上游轉錄調控因子分析:
轉錄因子 SPI1(PU.1)激活了該亞群 marker 基因的表達,并且 SPI1 本身也是這個亞群的 marker 基因
活動解釋權:
本活動的解釋權歸屬于 上海伯豪生物技術有限公司。
人工服務: