英文題目：A composite single-nucleotide polymorphism prediction signature for extranodal natural killer/T-cell lymphoma

發(fā)表期刊：Blood（IF 17.543）

通訊作者：中山大學(xué)腫瘤防治中心內(nèi)科蔡清清教授

DOI：10.1182/blood.2020010637

2021 年 3 月 16 日，中山大學(xué)腫瘤防治中心內(nèi)科蔡清清教授課題組在國(guó)際血液學(xué)期刊 Blood 上發(fā)表了題為：“A composite single-nucleotide polymorphism prediction signature for extranodal natural killer/T-cell lymphoma”的文章。蔡清清教授為通訊作者，中山大學(xué)腫瘤防治中心田小朋副研究員、馬淑云博士，美國(guó)杜克大學(xué) Ken H. Young 教授，新加坡國(guó)立癌癥中心 Choon Kiat Ong 教授，廣東省人民醫(yī)院劉艷輝教授為共同第一作者。該國(guó)際回顧性多中心隊(duì)列研究首先使用高通量 SNP 芯片（Illumina ASA，由伯豪生物提供服務(wù)）鑒定出與生存相關(guān)的 36 個(gè) SNP 位點(diǎn)。進(jìn)一步采用 LASSO 回歸模型構(gòu)建了一個(gè)基于 7 個(gè) SNP 的預(yù)測(cè)模型。創(chuàng)建的 ENKTL 單核苷酸多態(tài)性（Signal nucleotide polymorphism, SNP) 預(yù)后評(píng)價(jià)系統(tǒng)修正了腫瘤異質(zhì)性及活檢取材部位的偏差，作為有效工具個(gè)體化預(yù)測(cè) ENKTL 患者預(yù)后，可用于指導(dǎo)早期高危患者接受聯(lián)合放化療。該評(píng)價(jià)系統(tǒng)可為不同預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)的 ENKTL 患者指導(dǎo)精準(zhǔn)治療決策。

摘要：當(dāng)前基于臨床病理變量的預(yù)后評(píng)分系統(tǒng)不足以預(yù)測(cè)接受非蒽環(huán)類藥物治療的結(jié)外鼻型 NK/ T 細(xì)胞淋巴瘤（ENKTL）患者的生存和治療反應(yīng)。這項(xiàng)國(guó)際回顧性多中心隊(duì)列研究旨在構(gòu)建基于單核苷酸多態(tài)性（SNP）的分類器，以提高預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性并指導(dǎo)臨床決策。分析了來(lái)自國(guó)際多中心的 722 名 ENKTL 患者的數(shù)據(jù)，使用 LASSO  回歸在訓(xùn)練集（n = 336）中構(gòu)建了基于 7 -SNP 的分類器，并在內(nèi)部測(cè)試集（n=144）和兩個(gè)外部驗(yàn)證集（n=142; n=100）中進(jìn)一步進(jìn)行了驗(yàn)證。基于 7 -SNP 的分類器在訓(xùn)練集和三個(gè)驗(yàn)證集中顯示出良好的預(yù)后預(yù)測(cè)功效。由分類器計(jì)算的高風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分和低風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的患者表現(xiàn)出顯著不同的無(wú)進(jìn)展生存期（PFS）和總體生存期（OS）（所有 p  <0.001）。通過(guò)多變量分析進(jìn)一步證明了基于 7 -SNP 的分類器是一個(gè)獨(dú)立的預(yù)后因素，其預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性明顯優(yōu)于臨床病理風(fēng)險(xiǎn)變量。基于 7 -SNP 的分類器的應(yīng)用不受樣品類型及腫瘤異質(zhì)性的影響。值得注意的是，與單純放療相比，在高風(fēng)險(xiǎn)的 Ann Anbor I 期患者中，化學(xué)療法聯(lián)合放療的顯著改善了 PFS 和 OS，而在低危患者中，兩種治療方式之間沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。由分類器和臨床病理變量結(jié)合的 nomogram 評(píng)分系統(tǒng)明顯提高了預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。基于 7 -SNP 的分類器是對(duì) ENKTL 中現(xiàn)有風(fēng)險(xiǎn)分層系統(tǒng)的補(bǔ)充，這可能會(huì)對(duì) ENKTL 患者的臨床決策產(chǎn)生重大影響。