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伯豪生物
師兄又發文章了,我看著手里的冰凍組織很著急!
發布時間:2021-02-24 瀏覽次數:5985
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伯豪生物單細胞核產品加服務: 帶你乘風精準研核,發文章沖擊國自然!

伯豪生物單細胞核轉錄組測序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是從組織抽提細胞核,然后在單個細胞核水平上對轉錄組進行高通量測序分析的一項新技術,通過檢測單個細胞核的基因表達狀態,進而揭示細胞間的異質性。


技術流程

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單細胞核 RNA 測序(snRNA-seq)的優勢

1)冷凍組織可以用于直接抽提細胞核,為臨床回顧性研究中單細胞測序的開展提供了解決方案。

2)有些組織通過酶解消化很難拿到高質量的細胞懸液,通過抽提細胞核,避開酶解消化,是一個更好的選擇。

3)適用于對解離酶敏感(如神經元、肝實質細胞)、直徑較大、形狀不規則(如心肌細胞)等特殊細胞類型。

4)直接從組織抽提細胞核,不需要酶解消化及恒溫孵育,避免了組織解離過程中誘導應激基因的表達。


伯豪生物單細胞核 RNA 測序優勢

1、高質量抽核:抽核經驗豐富,針對不同組織優化了解決方案;

2、標準化內控:豐富的實操經驗構建了標準化的內控體系;

3、流程化分析:完善的分析流程,準確快速解析單細胞核轉錄組數據;

4、專業化團隊:資深的技術團隊具有多年項目方案設計、實驗操作、售后分析等經驗;

5、全流程服務:提供組織抽核、單細胞核捕獲、反轉錄、建庫測序及數據分析的全套服務。


伯豪生物豐富的單細胞核抽提經驗

利用自主研發的“伯優細胞核分離試劑盒”已經完成大腦皮層、下丘腦、海馬、延髓、松果體、肝臟、心臟、膠質瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多種組織的抽核制備及上機測序。

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送樣要求

1、組織用量:黃豆粒大小  1  塊;

2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;

3、質量要求:組織  RNA  無降解,RIN≥7;

4、運輸方式:干冰運輸。


應用方向

冷凍樣本;通過消化難拿到高質量的單細胞懸液的組織類型。


結果展示

1)腦組織

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▲腦組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結果  

腦組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:神經元(Neurons)73.0%;星形膠質細胞(Astrocytes)9.4%;少突膠質細胞(Oligodendrocytes)9.2%;內皮細胞(Endothelial cells)6.7%;小膠質細胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘膠質細胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。

2)心臟組織

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▲心臟組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結果

心臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:心肌細胞(Cardiomyocytes)38.8%;內皮細胞(Endothelial cells)30.3%;成纖維細胞(Fibroblasts)16.6;神經元細胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬細胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;間皮細胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 細胞分別占 0.4%;中性粒細胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪細胞(Adipocytes)0.2% 及髓細胞(Myeloid cells)0.1%。

3)肝臟組織

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▲肝臟組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結果  

肝臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:肝細胞(Hepatocytes)56.0%;內皮細胞(Endothelial cells)10.9%;膽管細胞(Cholangiocytes)9.4%;成纖維細胞(Fibroblasts)9.2%;星狀細胞(Stellate cells)8.7%;T 細胞 4.7% 及 B 細胞 1.1%。


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