學(xué)術(shù)無價,科研無假。新年以來,伯豪文獻(xiàn)捷報頻傳,小編從中挑選了《Cancer Reserch》新鮮出爐的一篇 miRNA 相關(guān)文章,與大家分享。
miRNA 研究持續(xù)高熱,然而 mirRNA 對線粒體基因組調(diào)控的研究卻鮮有報道。中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院李勁松課題組,在舌鱗狀細(xì)胞癌(TSCC)耐藥細(xì)胞株中,篩選出了特異高表達(dá)的 mitomiR-2392。miR-2392 能夠抑制氧化磷酸化(OXPHOS),激活糖酵解作用,從而重新編碼代謝過程。并且,miR-2392 調(diào)控線粒體基因表達(dá)影響了 TSCC 患者的化療敏感性和總生存率。相關(guān) miRNA 芯片服務(wù)由伯豪提供。
研究思路
研究結(jié)果
1.miRNA 芯片篩選 TSCC 耐藥細(xì)胞株中線粒體特異高表達(dá)的 miRNA。
通過 miRNA 芯片實驗,TSCC 化療耐藥細(xì)胞株中線粒體特異高表達(dá)的 11 個候選 miRNA, 其中,表達(dá)差異顯著的是 miR-2392。通過分析多種癌癥的 GEO 數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn) miR-2392 的表達(dá)均有顯著升高的趨勢。
2.mitomiR-2392 抑制線粒體基因轉(zhuǎn)錄,影響線粒體氧化磷酸化
mtDNA 長約為 16.6 kb,負(fù)責(zé)編碼 OXPHOS 通路的 13 個主要亞基,其中,12 個線粒體基因是從 H 鏈轉(zhuǎn)錄 [1],只有 ND6 從 L 鏈轉(zhuǎn)錄 [2]??紤]到 miR-2392 高表達(dá)的細(xì)胞中,線粒體主要復(fù)合物以及 ATP 水平都顯著降低,miR-2392 可能也會通過部分堿基配對影響線粒體基因組的表達(dá)。
不同于核基因,線粒體基因組存在較高頻率的變異,而生信分析表明,線粒體 H 鏈上存在與 miR-2392 結(jié)合的高度保守區(qū)域。進(jìn)一步的實驗結(jié)果表明,miR-2392 對線粒體基因的表達(dá)的調(diào)控作用,需要保守的 5’端結(jié)構(gòu)維持。
3.miR-2392 調(diào)控線粒體基因組表達(dá)的模型
在特定的細(xì)胞條件 [3-5],細(xì)胞質(zhì)中的 miRNA 抑制轉(zhuǎn)錄,需要結(jié)合 RNA 轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物(RISC)[6,7],AGO2 蛋白是轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合體的重要成員,AGO2-miRNA 已被證明在 TSCC 細(xì)胞模型中能夠抑制核基因的表達(dá)。Rip-seq 和 Co-IP 實驗證實了 AGO2 和 miR-2392 的結(jié)合作用,從而揭示了 miR-2392 調(diào)控線粒體基因組表達(dá)的可能機(jī)制:AGO2 的協(xié)同作用下,mitomiR-2392 識別 H 鏈中的靶序列,部分抑制多順子 mtDNA 轉(zhuǎn)錄?;仡櫺匝芯恳豺炞C了,TSCC 患者的化療敏感性和總生存率與 miR-2392 參與的線粒體基因表達(dá)數(shù)據(jù)之間存在顯著相關(guān)性。
研究結(jié)論:該研究揭示了 mitomiR 在 mtDNA 轉(zhuǎn)錄中的作用及其對腫瘤細(xì)胞代謝和化療耐藥的分子作用機(jī)制,為腫瘤藥物的研發(fā)提供了新的思路。
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